„Pagrindinis žvalgybos institucijų veiklos tikslas – stiprinti Lietuvos Respublikos nacionalinį saugumą, renkant informaciją apie rizikos veiksnius, pavojus ir grėsmes, pateikiant ją nacionalinį saugumą užtikrinančioms institucijoms ir šalinant šiuos rizikos veiksnius, pavojus ir grėsmes.“ – LR žvalgybos įstatymas, 6 straipsnis.
Departamentas, vadovaudamasis Valstybės gynimo tarybos patvirtintais žvalgybos informacijos poreikiais ir prioritetais, vykdo žvalgybą ir kontržvalgybą. Krašto apsaugos ministras, vadovaudamasis Valstybės gynimo tarybos patvirtintais žvalgybos informacijos poreikiais ir prioritetais, nustato Departamentui užduotis.
Departamentas įgyvendina Valstybės gynimo tarybos patvirtintą AOTD 2026–2030 m. veiklos strategiją.
Departamento strateginiai tikslai:
- Perspėjimas laiku ir grėsmių užkardymas;
- Profesionalus, motyvuotas ir lojalus personalas;
- Veikla, grindžiama pažangiomis technologijomis ir inovaciniais sprendimais;
- Efektyvus bendradarbiavimas.
Departamento vertybės:
- Profesionalumas – efektyviai naudojame žinias, patirtį ir gebėjimus vykdydami užduotis. Nuolat tobulėjame ir padedame tobulėti kitiems. Objektyviai vertiname situacijas, mūsų darbai yra pagrįsti, atliekami laiku.
- Lyderystė – veikiame ambicingai, priimdami sudėtingus sprendimus, ir savo pavyzdžiu įkvepiame veikti kitus. Prisiimame atsakomybę. Esame ryžtingi ir atviri naujoms idėjoms ir pokyčiams.
- Pasitikėjimas – pasitikime organizacija, organizacija pasitiki mumis. Laikomės įsipareigojimų tarpusavyje ir partneriams. Esame vieningi, gerbiame save ir kitus.
- Bendradarbiavimas – dirbame proaktyviai komandoje, įgyvendindami karinės žvalgybos misiją ir siekdami bendrų tikslų.
Žvalgybos ciklas – tai procesas, per kurį suformuojami žvalgybos informacijos poreikiai ir nustatomi prioritetai, tada informacija renkama, apdorojama ir analizuojama, paverčiama žvalgybiniu vertinimu, ir pateikiama gavėjams, vartotojams.

Pagal LR žvalgybos įstatymo 11 str. Departamentas renka informaciją:
- taikydamas žvalgybos metodus;
- atlikdamas teismo sankcionuojamus veiksmus;
- gaudamas duomenis iš valstybės ir žinybinių registrų, informacinių sistemų ir duomenų bazių;
- gaudamas duomenis iš juridinių ir (ar) fizinių asmenų.
Žvalgybos metodų taikymo tvarką, terminus ir sąlygas nustato LR Vyriausybė (Žvalgybos įstatymo 12 str.).
Galimi žvalgybos metodai:
- OSINT – atvirųjų šaltinių žvalgyba,
- HUMINT – agentūrinė, arba žmogiškoji, žvalgyba,
- SIGINT – signalų žvalgyba,
- COMINT – komunikacijų žvalgyba,
- ELINT – elektroninė žvalgyba,
- CYBERINT – kibernetinė žvalgyba,
- IMINT – atvaizdų žvalgyba,
- RADINT – žvalgyba radiolokacinėmis priemonėmis,
- ACINT – akustinė žvalgyba,
- MASINT – matavimų žvalgyba ir kt.
Departamentas glaudžiai bendradarbiauja su LR nacionalinį saugumą užtikrinančiomis ir kitomis institucijomis, užsienio partneriais, NATO ir ES, keičiasi žvalgybos informacija ir vertinimais.
Kiekvienais metais AOTD pristato visuomenei AOTD veiklos rezultatus neįslaptintoje veiklos ataskaitoje, taip pat kartu su Valstybės saugumo departamentu bendrai rengia Grėsmių nacionaliniam saugumui vertinimą.